Mehr als ein Fünftel der Pflanzensorten auf der Welt sind vom Aussterben bedroht.[i] Die Überweidung durch Viehbestände haben die Pflanzenbestände deutlich reduziert, während gebietsfremde Pflanzen eine weitere Bedrohung darstellen. Die Verstädterung und die fortschreitende Intensivierung der Landwirtschaft haben ebenfalls unzählige Pflanzenarten zerstört oder ihr Habitat eingeschränkt. Heute sind auch CWRs von diesen Gefahren bedroht.
Einige wichtige CWR-Spezies haben ausgesprochen beschränkte Lebensräume. Beispielsweise wächst der wilde Verwandte unseres Maises Zea nicaraguensis nur an einem einzigen, geschützten Ort in Nicaragua, während die wilde Sonnenblumenspezies Helianthus paradoxus gerade einmal sechs kleine Lebensräume in Texas, Utah und New Mexico in den USA vorweisen kann.
Der Klimawandel stellt eine weitere Herausforderung dar: ca. 16-22 % der CWRs von Erdnüssen, Kartoffeln und Augenbohnen werden bis 2055 wohl verschwunden sein,[ii] während die sich ändernden Umweltbedingungen die möglichen Lebensräume für Mais-CWRs stark dezimieren werden.[iii]
