El uso de parientes silvestres de cultivos para la mejora vegetal es un proceso largo y laborioso que, normalmente, resulta mucho más complejo que la mejora con variedades cultivadas. Muchos obtentores evitan utilizar parientes silvestres de cultivos por esta razón. El primer paso para utilizar PSC en la mejora de los cultivos es la pre-mejora, un componente esencial del proyecto que consiste en actividades cuya finalidad es aislar los rasgos genéticos deseados (p. ej., resistencia a enfermedades) e introducirlos en líneas de mejora que puedan cruzarse más fácilmente con las variedades de élite modernas.
Hasta ahora, el proyecto ha lanzado dos estudios piloto de pre-mejora: uno de arroz en colaboración con el Instituto Internacional de Investigación del Arroz y la Universidad Cornell, y otro de girasol en colaboración con la Universidad de Columbia Británica. Los resultados iniciales han revelado rasgos diversos e interesantes para la floración temprana en la especie silvestre de girasol Helianthus hirsutus, un rasgo clave para la adaptación al cambio climático debido a los períodos vegetativos cambiantes. Además, se descubrió que otro espécimen de H. hirsutus tenía una diversidad genética potencialmente utilizable para aumentar la productividad, a pesar de su distancia evolutiva con el girasol cultivado, el Helianthus annuus.
Se organizaron consultas con expertos en pre-mejora respecto a varios de los acervos genéticos de los cultivos deseados, que ayudaron a priorizar y orientar el desarrollo de proyectos sobre pre-mejora y evaluación de parientes silvestres de cultivos. Además de los dos estudios piloto, hasta ahora se han desarrollado proyectos para otros siete cultivos: la patata, la lenteja, la berenjena, el garbanzo, la zanahoria, el trigo (duro) y la batata. Los proyectos de pre-mejora incluyen componentes de generación de capacidades y cuentan con la colaboración de investigadores del sistema CGIAR, universidades y participantes de países en vías de desarrollo. Por ejemplo, el equipo encargado del proyecto de pre-mejora de la patata incluye el Centro Internacional de la Papa (CIP) de Perú, el Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA) de Uruguay y la Empresa Brasileña de Investigación Agropecuaria (EMBRAPA).