项目第一阶段着重创建一份全球农作物野生亲缘植物清单和一个检索数据库，并展开缺口分析，得到农作物野生亲缘种未被采集地点的详尽信息。该初始研究步骤帮助我们识别了需要采集的农作物野生亲缘植物和采集地点，并为它们划分优先级。识别和优先级划分是根据一个全球现有收藏数据集、专家评估以及依照哈兰和德·韦特（1971）基因池概念得出的每一物种的育种使用难度确定的。[i] 农作物野生亲缘植物清单覆盖了约193种农作物的基因池，缺口分析则涉及81个基因池。
为了认证缺口分析得出的优先保存分数，我们还将其交由专家进行评估。根据他们对农作物野生亲缘植物的了解，我们选择了44位专家。他们根据自己观点中基因库现存每种农作物野生亲缘种收藏的合适度为它们各自打出了一个分数，并提出了他们认为存在的地理和环境缺口。专家还给出了一个额外分数来反映自己对每一个分类群对于植物育种的用处以及该物种在其自然栖息地所面临威胁的看法。最终，我们使用多因子分析（MFA）估算出一个综合指数，用以概括专家给出的所有评价。
本项目团队识别了29种重点采集农作物的最近缘野生亲缘植物分类群，对它们进行了优先级划分，并使用这些分类群确定了采集国家。本项目还与一些国家级合作伙伴建立了伙伴关系，由他们完成所在国农作物野生亲缘植物的采集工作。此外，我们还开展了两项水稻和向日葵的前育种先导性项目，还与其他机构建立了伙伴关系，以启动针对其他若干种农作物的前育种项目。
前育种项目预计将针对上述29种农作物中的大约20种展开。
